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Le séquençage de cellules individuelles, ou séquençage single cell, est une technique révolutionnaire en biologie moléculaire qui permet de comprendre les différences subtiles entre les cellules individuelles d’un même tissu ou organisme. Cette technique est de plus en plus utilisée dans de nombreux domaines de recherche, notamment en cancérologie, en neurosciences et en développement embryonnaire.

Le séquençage single cell permet d’analyser l’ARN et l’ADN de cellules individuelles, ce qui permet d’obtenir des informations précieuses sur l’expression génique, la structure des chromosomes et la diversité des cellules dans un tissu donné. Les données obtenues à partir du séquençage single cell peuvent aider à identifier des sous-populations de cellules qui ont des caractéristiques uniques et à comprendre comment ces cellules interagissent les unes avec les autres.

Le séquençage single cell repose sur deux technologies principales: la microdissection et la séquence d’ARN à cellule unique. La microdissection consiste à isoler une cellule individuelle à partir d’un tissu, tandis que la séquence d’ARN à cellule unique permet d’analyser l’ARN extrait de cette cellule unique. Les cellules peuvent être isolées à l’aide de plusieurs méthodes différentes, notamment la FACS (tri cellulaire en flux), la pipette à cellules et la microfluidique.

Le séquençage single cell a permis de faire des découvertes importantes dans de nombreux domaines de recherche. Par exemple, en cancérologie, cette technique a permis d’identifier des sous-populations de cellules cancéreuses qui sont résistantes à la chimiothérapie et qui contribuent à la progression de la maladie. En neurosciences, le séquençage single cell a permis d’identifier des sous-populations de cellules qui sont impliquées dans la formation de la mémoire et dans la plasticité synaptique.

En conclusion, le séquençage single cell est une technique puissante qui permet d’analyser les différences subtiles entre les cellules individuelles. Cette technique est de plus en plus utilisée dans de nombreux domaines de recherche et a permis de faire des découvertes importantes dans la compréhension de diverses maladies et processus biologiques.

Sources:

Svensson, V., & Teichmann, S. A. (2016). Stepping stones in the journey to single-cell transcriptomics. Nature biotechnology, 34(6), 613-620.

Tirosh, I., Izar, B., Prakadan, S. M., Wadsworth, M. H., Treacy, D., Trombetta, J. J., … & Suvà, M. L. (2016). Dissecting the multicellular ecosystem of metastatic melanoma by single-cell RNA-seq. Science, 352(6282), 189-196.

Raj, A., & van Oudenaarden, A. (2008). Nature, nurture, or chance: stochastic gene expression and its consequences. Cell, 135(2), 216-226.